Впервые село Любечане при р.Клюсе (она же Гнилая-Вода) упоминается в 1620 году как «Ляхова пустошь». В 1620 году входило в состав рубцовских имений. В Универсале гетмана Мазепы в 1688 году «селище Ляховы Любечане» упомянуто как общее имение Михаила и Ильи Рубцов. В селе были также дворы, принадлежавшие Семену и Федору Рубцам, Степану Лашкевичу, гусару Ивану Багинскому.
До 1781 года село входило в Топальскую сотню Стардубского полка. В 1781 году село входило в Новгородсеверское наместничество. В «Описании Новгородсеверского наместничества 1779-1781 гг.» о селе говорится: «Лежит оное по столбовой дороге идучой из Ропска в Стародуб. Местоположение оного села узложисто, промеж ярками, неровное, при чистом пахатном поле, при чагарниках и небольшой роще, не песчаное и не болотное. Речки никакой нет (в 1620 г. указывается речка), а довольствуется водою из колодцев, коих здесь четыре. Публичного и партикулярного строения в нем нет. Церковь деревянная. В селе 1 священник. 1 причетник».
Затем было в Новоместском, Новозыбковском уезде (с 1808 г.). С 1861 года в составе Новоропской волости., с 1923 г. - в Климовской волости. С 1929 г. – в Климовском районе. До 1960 г. центр Любечанского сельского Совета. Сейчас входит в Брахловское поселение.
В селе был храм Михаила Архангела, упоминавшийся с 1780 года по 20-е годы ХХ века. В 1902 году построено новое здание храма деревянное (не сохранилось).
Близ села обнаружены курганные могильники древнерусского времени, известны с конца 19 в. Всего в районе села обнаружено 9 могильников.
В известном труде В.Е.Варзера «Материалы для оценки земельных угодий (Чернигов, 1880 г.) дается оценка земель в с.Любечане (тогда Любечаны). Земли здесь разделяются резко на три сорта: чернозем, серопесчаная и песчаная. Каждый сорт земли приблизительно в равных количествах. Засевается на черноземе преимущественно овес, на остальных землях - гречка.
Население
Год Всего дворов Всего жителей
1866 776
1880 147 865
1897 868
1901 1081
1924 196 1001
1926 943
1979 611
1989 469
2002 343
2010 274
2011 262
Т.Полетаева